Rùa và Shredder chiến đấu một lần nữa, lần này là để giành lấy hộp chứa chất lỏng cuối cùng đã tạo ra Rùa, mà Shredder muốn tạo ra một đội quân gồm những dị nhân mới.
Khi người cha sống ngoài vòng pháp luật bị bắt cóc, Tommy “White Knife” Stockburn cùng 5 người anh em mà anh chưa từng biết đến đi khắp miền Tây để giải cứu cha.
